Aegna loodusmaja pakub võimalust osaleda loodus- ja keskkonnahariduslikes õppekavakohastes programmides ja looduslaagrites. Õppepäeval keskendutakse peamiselt looduse vahetule kogemisele (õppekäik metsas ja mere ääres) ning praktilistele tegevustele. Õppepäeva jooksul tehakse lihtsamaid loodusvaatlusi ning viiakse läbi uurimuslikke tegevusi.
Programmid on mõeldud nii eelkooli, põhikooli kui gümnaasiumi õpilastel.
Tallinna õpilastele on loodusmaja teenuste kasutamine tasuta.
Hooaeg loodusmajas kestab 15. maist kuni 30. septembrini.
Aegna loodusmaja õppeprogrammide ja teenuste broneerimine toimub Tallinna Keskkonna - ja Kommunaalameti veebilehe kaudu, alates 15. märtsist.